Guayaquil Siglo XXI, Fundación Municipal para la Regeneración Urbana está conformada por los siguientes órganos de dirección y administración:

• Asamblea
  • M. I. Municipalidad de Guayaquil
  • Junta Cívica de Guayaquil
• Directorio
  • Dra. Beatrice Lamincia Chiocca, Miembro Titular - Presidente
  • Arq. José Núñez Cristiansen, Miembro Titular - Vicepresidente
  • Arq. Mauro Pérez Moreno, Miembro Alterno
  • Dr. Miguel Palacios Frugonne, Miembro Titular
  • Ab. Héctor Romero Tanca, Miembro Alterno
  • Econ. Manuel García Peñafiel, Miembro Titular
  • Econ. Omar Stracuzzi Ordoñez, Miembro Alterno
  • Ing. Jorge Berrezueta Peñaherrera, Miembro Titular
  • Ing. Manuel Sarmiento Tomalá, Miembro Alterno
  • Ab. Xavier Sandoval Baquerizo, Miembro Titular
  • Ab. Ramiro Domínguez Narváez, Miembro Alterno
  • Arq. Guillermo Arguello Santos, Miembro Titular
  • Arq. Félix Chávez Pesantes, Miembro Alterno
  • Ing. Alfredo Mancheno Orellana, Asesor
• Gerente General    
  • Ing. Wilfrido Matamoros Morla

• Comisión Ejecutiva
  • Dra. Beatrice Lamincia Chiocca, Miembro Titular - Presidente
  • Arq. José Núñez Cristiansen, Miembro Titular
  • Arq. Mauro Pérez Moreno, Miembro Alterno
  • Ing. Wilfrido Matamoros Morla, Gerente General
  • Ing. Galo Pérez Mortola, Miembro Alterno
  • Ing. Alfredo Macheno Orellana, Asesor
  • Econ. Manuel García Peñafiel, Asesor
  • Arq. Guillermo Arguello Santos, Asesor
  • Ing. Jorge Berrezueta Peñaherrera, Asesor